RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM87AP0C7U9 286 aa11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 MDH2P40926 338 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 LIMS1P48059 325 aa11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 NAAAQ02083 359 aa11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 FUT5Q11128 374 aa11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 ELOBQ15370 118 aa11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 HES3Q5TGS1 186 aa11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 HOGA1Q86XE5 327 aa11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR10C1Q96KK4 312 aa11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 R4GN57 208 aa11.94□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SHISA7A6NL88 538 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 GLULP15104 373 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 HOXC8P31273 242 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 R3HDM4Q96D70 268 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SNURFLB1AK76 121 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 HYAL1Q12794 435 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1W2PQD3 144 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 ST8SIA5O15466 376 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPINT1O43278 529 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 NDUFB3O43676 98 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM157CP0CG43 387 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SRD5A2P31213 254 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SULT1A2P50226 295 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 GNB2P62879 340 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL19A1Q14993 1142 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 CEBPEQ15744 281 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC01387J3KSC0 135 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM50BP56557 158 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRRC3CA6NJW4 275 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR2M7Q8NG81 312 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM204Q9BSN7 226 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 MESP2Q0VG99 397 aa11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLK2P20151 261 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR1L6Q8NGR2 347 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 PSG2P11465 335 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR4F17Q8NGA8 305 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TBX15Q96SF7 602 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL18A1P39060 1754 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 PIN1P1O15428 100 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHST5Q9GZS9 411 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNFRSF1AP19438 455 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 PMELP40967 661 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 GGTLC2Q14390 218 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRRC10Q5BKY1 277 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 ID4P47928 161 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADAMTSL3P82987 1691 aa11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR10J1P30954 320 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 KHDC3LQ587J8 217 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPINK14Q6IE38 97 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 GLI3P10071 1580 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 RSG1Q9BU20 258 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00518Q8N0U6 118 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SGMS2Q8NHU3 365 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TINAGQ9UJW2 476 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR2W1Q9Y3N9 320 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNFSF14O43557 240 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 LMX1BO60663 402 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 MEOX1P50221 254 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 IL11RAQ14626 422 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q56UQ5 140 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 NHLRC3Q5JS37 347 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCL17Q92583 94 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 FOXS1O43638 330 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 C16orf82Q7Z2V1 217 aa11.91□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 K7EQS6 105 aa11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 SP1P08047 785 aa11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAB7AP51149 207 aa11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 FOXO1Q12778 655 aa11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 C3AR1Q16581 482 aa11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 ABHD3Q8WU67 409 aa11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms