RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627540.2

PCBP1-AS1-317, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 662 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 IDI1Q13907 227 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 DSC3Q14574 896 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 HCN2Q9UL51 889 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 NWD1Q149M9 1564 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SV2AQ7L0J3 742 aa9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 MARK1Q9P0L2 795 aa9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ADGRB3O60242 1522 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 KANK1Q14678 1352 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SASH3O75995 380 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 KCNQ4P56696 695 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ELP3Q9H9T3 547 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 LRP6O75581 1613 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 DAPK1P53355 1430 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 FGFR3P22607 806 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 LAMC2Q13753 1193 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 CCINQ13939 588 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 PHF24Q9UPV7 400 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 NOS1P29475 1434 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 MSH6P52701 1360 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SPEM2Q0P670 501 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ZNF787Q6DD87 383 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 XKR5Q6UX68 686 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 PNMA5Q96PV4 448 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SETDB2Q96T68 719 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SLC30A3Q99726 388 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 GSX2Q9BZM3 304 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 JCADQ9P266 1359 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 TNFRSF21O75509 655 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 EGFRP00533 1210 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 COL19A1Q14993 1142 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 NLRP13Q86W25 1043 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.9□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 RARAP10276 462 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 NFKB1P19838 968 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 CTBSQ01459 385 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 BHMTQ93088 406 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 CSRNP1Q96S65 589 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 PHACTR2O75167 634 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 NEFLP07196 543 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 CNTN3Q9P232 1028 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ZFYVE9O95405 1425 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ATP2B2Q01814 1243 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 ZFATQ9P243 1243 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 UNCXA6NJT0 531 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 MMP20O60882 483 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 CHRDQ9H2X0 955 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 SHPRHQ149N8 1683 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 EREGO14944 169 aa9.85□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 BMP4P12644 408 aa9.85□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-317ENST00000627540 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms