RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRGPRFQ96AM1 343 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 UFSP2Q9NUQ7 469 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP24Q9UPU5 2620 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM82A0PJX8 343 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 A6NLC8 198 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2AT4A6NND4 320 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRSS44E7EML9 344 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL5P05113 134 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FCGR3AP08637 254 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PGA5P0DJD9 388 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNLYP22749 145 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSPAN5P62079 268 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPPED2Q15777 294 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RHOFQ9HBH0 211 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 EHFQ9NZC4 300 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDRG3Q9UGV2 375 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 VSIG4Q9Y279 399 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBASA2RRP1 2371 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 HS3ST1O14792 307 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KALRNO60229 2985 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NXPH2O95156 264 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DTYMKP23919 212 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 UQCRFS1P47985 274 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERVK11-1P61568 191 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TLE1Q04724 770 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL13RA2Q14627 380 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC22A25Q6T423 547 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRIP2Q9BQI9 281 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CA10Q9NS85 328 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF69Q9UC07 566 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRNP28799 593 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBMXP38159 391 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARPC4P59998 168 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZMYND11Q15326 602 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCMAPQ5T1S8 102 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD276Q5ZPR3 534 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00596Q86U02 117 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q8IYB0 196 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR11H7Q8NGC8 314 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEK7Q8TDX7 302 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RDH5Q92781 318 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TLNRD1Q9H1K6 362 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPA2Q9H2U2 334 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 EDARQ9UNE0 448 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEGS1O15121 323 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 PMELP40967 661 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 SELENOVP59797 346 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 TFF3Q07654 80 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 MZT1Q08AG7 82 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARRDC1Q8N5I2 433 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 MED30Q96HR3 178 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ING3Q9NXR8 418 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP23Q9Y6H3 246 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ICE1Q9Y2F5 2266 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAV24A0A0B4J272 114 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLSCR5A0PG75 271 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 WNT9BO14905 357 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPRY3O43610 288 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF44P15621 663 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 CXCL3P19876 107 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDK10Q15131 360 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 C4orf46Q504U0 113 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6P435 159 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZPA2 131 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 OVCH2Q7RTZ1 564 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 POC1AQ8NBT0 407 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 TERB2Q8NHR7 220 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 MARCH1Q8TCQ1 289 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ELMOD3Q96FG2 381 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF222Q9UK12 451 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa15.06■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPY4RP50391 375 aa15.06■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF626Q68DY1 528 aa15.06■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR82Q6UXN9 313 aa15.06■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM17Q86X19 198 aa15.06■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC01560Q8TB33 94 aa15.06■□□□□ 0
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR13Q9H1Z4 485 aa15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms