RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	OR3A4P	P47883	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	POU3F4	P49335	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RAB11B	Q15907	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CARTPT	Q16568	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ABCA1	O95477	2261 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0G2JMP0	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0X1KG70	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		A0A1W2PPH5	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ISPD	A4D126	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		M0R1W7	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DEGS1	O15121	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PSPN	O60542	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	FCN3	O75636	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DIRAS3	O95661	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR2H2	O95918	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GYPA	P02724	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CGB3	P0DN86	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CGB7	P0DN87	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MGMT	P16455	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GZMH	P20718	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GNB2	P62879	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	UNC119	Q13432	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	BLMH	Q13867	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	P2RY14	Q15391	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CCL13	Q99616	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63

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