RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZSR3 168 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF561Q8N587 486 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 NRBF2Q96F24 287 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 PLXNB1O43157 2135 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 METTL15A6NJ78 407 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ACOD1A6NK06 481 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 C17orf98A8MV24 154 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 H3BNX3 289 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 K7N7A8 449 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SIRPB1O00241 398 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SLC1A7O00341 560 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 DYNC1I1O14576 645 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TIMM23O14925 209 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SYT7O43581 403 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ENTPD6O75354 484 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 KRT8P05787 483 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 FASP25445 335 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 HTR1FP30939 366 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TGFBR2P37173 567 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ACSM1Q08AH1 577 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 BLMHQ13867 455 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SNCBQ16143 134 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF573Q86YE8 665 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 FGGYQ96C11 551 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CEP19Q96LK0 163 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 MBOAT4Q96T53 435 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ABCB9Q9NP78 766 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1W2PRX2 142 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 A6NDX4 124 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ODF3BA8MYP8 253 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 E9PI62 339 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 EI24O14681 340 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 HAND1O96004 215 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-7P01780 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CSF1P09603 554 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ATP6V1B1P15313 513 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 PRKACAP17612 351 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GABRR1P24046 479 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ISL1P61371 349 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 SCN1BQ07699 218 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 IL24Q13007 206 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 LPCAT4Q643R3 524 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GID4Q8IVV7 300 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ORAI1Q96D31 301 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 RNFT2Q96EX2 444 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TEX12Q9BXU0 123 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 MMP28Q9H239 520 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 AMBNQ9NP70 447 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 RASL12Q9NYN1 266 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 USE1Q9NZ43 259 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TGP01266 2768 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 J3QLW9 94 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 J3QRE1 110 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 HSPB6O14558 160 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR2T7P0C7T2 308 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF728P0DKX0 622 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF19P17023 458 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 KIR2DS4P43632 304 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC3-211ENST00000491581 OR3A1P47881 315 aa7.16□□□□□ -1.26
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