RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PARP8	Q8N3A8	854 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SGK3	Q96BR1	496 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NOTCH1	P46531	2555 aa		14.75	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	VWF	P04275	2813 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C22orf46	C9J442	243 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	LHB	P01229	141 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	APOC1	P02654	83 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OSM	P13725	252 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	HSD11B1	P28845	292 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NPY4R	P50391	375 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK5	Q00535	292 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	GINS1	Q14691	196 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNJ8	Q15842	424 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL12	Q53G59	568 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	REEP6	Q96HR9	211 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	DUX5	Q96PT3	197 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		14.74	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	GNGT2	O14610	69 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TBX1	O43435	398 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	IL13RA1	P78552	427 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MZT1	Q08AG7	82 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	BAMBI	Q13145	260 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TIGD6	Q17RP2	521 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MIDN	Q504T8	468 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR86	Q86TI4	376 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OTOS	Q8NHW6	89 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLITRK2	Q9H156	845 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SP140L	Q9H930	580 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		14.73	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OOEP	A6NGQ2	149 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	C3orf80	F5H4A9	247 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PRODH	O43272	600 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFA2	O43678	99 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	GRP	P07492	148 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	LYN	P07948	512 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ANXA8	P13928	327 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	POU1F1	P28069	291 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FLOT2	Q14254	428 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM57B	Q71RH2	274 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OTULIN	Q96BN8	352 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	POMP	Q9Y244	141 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0G2JK05	382 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN34	H7C241	214 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	GYG2	O15488	501 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SELENOF	O60613	162 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FKBP6	O75344	327 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FCN3	O75636	299 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	HMGN1	P05114	100 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKACG	P22612	351 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC2A5	P22732	501 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	GSK3A	P49840	483 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	CBX1	P83916	185 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8B8	Q15620	311 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA24	Q86W54	205 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A28	Q96A46	364 aa		14.71	□□□□□ -0.05

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