RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM210AQ96ND0 272 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 MS4A4EQ96PG1 132 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC29A1Q99808 456 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 MED10Q9BTT4 135 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2AG1Q9H205 316 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 CENPHQ9H3R5 247 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 MIEF1Q9NQG6 463 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.3□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 ALPK2Q86TB3 2170 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GU03 582 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 A8MX80 341 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 SHISA9B4DS77 424 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 GOSR2O14653 212 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF254O75437 659 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 CTDNEP1O95476 244 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 TGM6O95932 706 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFP01375 233 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 ADRB3P13945 408 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 MSR1P21757 451 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 GCKP35557 465 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 RWDD2BP57060 319 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 PAX2Q02962 417 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 PNOCQ13519 176 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 GNMTQ14749 295 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM182AQ5T1J6 154 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 C22orf42Q6IC83 251 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 OR52W1Q6IF63 320 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 REEP3Q6NUK4 255 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 TMUB2Q71RG4 321 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC16A14Q7RTX9 510 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1E3Q8WZA6 343 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 C8orf44Q96CB5 159 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 TSGA10Q9BZW7 698 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.29□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 UGT1A9O60656 530 aa4.28□□□□□ -1.72
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STRADBP1-201ENST00000478954 SERPINE2P07093 398 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC35E2P0CK97 266 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 IL12AP29459 219 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 RRM2P31350 389 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC1A2P43004 574 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 RGRP47804 291 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 PAX8Q06710 450 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 IRF4Q15306 451 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF613Q6PF04 617 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 VTCN1Q7Z7D3 282 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00523Q86TU6 105 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 PIANPQ8IYJ0 282 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 Q8N377 158 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 ACOT4Q8N9L9 421 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 PAGE5Q96GU1 130 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC22AQ96IW7 307 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 DUX3Q96PT4 197 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 GAL3ST1Q99999 423 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 SRXN1Q9BYN0 137 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 NMUR2Q9GZQ4 415 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 DYRK4Q9NR20 520 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 PLLPQ9Y342 182 aa4.28□□□□□ -1.72
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0G2JRQ6 117 aa4.27□□□□□ -1.73
STRADBP1-201ENST00000478954 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM107AO95990 144 aa4.27□□□□□ -1.73
STRADBP1-201ENST00000478954 MYL2P10916 166 aa4.27□□□□□ -1.73
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