RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 GABRA5P31644 462 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 STX2P32856 288 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 CFHR2P36980 270 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 MAP3K8P41279 467 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 OR3A1P47881 315 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 RASSF2P50749 326 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 MTCP1P56278 107 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 HERV-K104P63124 156 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 SORDQ00796 357 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC3A1Q07837 685 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 VAMP3Q15836 100 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 ACKR1Q16570 336 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 RBBP7Q16576 425 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 MTX3Q5HYI7 312 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 TEX30Q5JUR7 227 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 H3F3CQ6NXT2 135 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 UQCC3Q6UW78 93 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 IL17RELQ6ZVW7 336 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 LINGO2Q7L985 606 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 ARHGAP24Q8N264 748 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 DNAJC22Q8N4W6 341 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 MAGEC3Q8TD91 643 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 NEK7Q8TDX7 302 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 ASB5Q8WWX0 329 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 DDB2Q92466 427 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 SMPDL3BQ92485 455 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 AP3S1Q92572 193 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 CMTM5Q96DZ9 223 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 FBXO17Q96EF6 278 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 C18orf12Q96KH6 178 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 MARK4Q96L34 752 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 C10orf90Q96M02 699 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF285Q96NJ3 590 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 OR5B2Q96R09 309 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 PRRT1Q99946 306 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 PSD2Q9BQI7 771 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 UCK2Q9BZX2 261 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 C1orf198Q9H425 327 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 WDR54Q9H977 334 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 MYNNQ9NPC7 610 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 RMND1Q9NWS8 449 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 GID8Q9NWU2 228 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 IFNKQ9P0W0 207 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 ANAPC7Q9UJX3 599 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 FBXL3Q9UKT7 428 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 MGAM2Q2M2H8 2515 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 DOCK7Q96N67 2140 aa3.4□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 RYR3Q15413 4870 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 A0A0J9YVX5 310 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 RFXANKO14593 260 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 CLOCKO15516 846 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 EMC8O43402 210 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 GMDSO60547 372 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 TSPAN2O60636 221 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 PFDN1O60925 122 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 OR2B3O76000 313 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 RGS11O94810 467 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 HIST1H2ABP04908 130 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 F7P08709 466 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 HBQ1P09105 142 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 CD48P09326 243 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.39□□□□□ -1.87
CYCSP43-201ENST00000438233 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms