RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MAGED4Q96JG8 741 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SLC35A5Q9BS91 424 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CRB3Q9BUF7 120 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 RMND5AQ9H871 391 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 IL17BQ9UHF5 180 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 USP22Q9UPT9 525 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SNX8Q9Y5X2 465 aa7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 AKAP13Q12802 2813 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PLOD2O00469 737 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PSMG1O95456 288 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 DDAH2O95865 285 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CBX7O95931 251 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 IFNA16P05015 189 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 KRT16P08779 473 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SSTR4P31391 388 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MPIP34949 423 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 GPC1P35052 558 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 DLSTP36957 453 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PGDP52209 483 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SLC7A2P52569 658 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PSME3P61289 254 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MXRA7P84157 204 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SERTAD2Q14140 314 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SAXO2Q658L1 398 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TMEM205Q6UW68 189 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 VASH2Q86V25 355 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 OR2L13Q8N349 312 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NATD1Q8N6N6 113 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 FBXO30Q8TB52 745 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ZNF675Q8TD23 568 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 RIT1Q92963 219 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ROPN1LQ96C74 230 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NXPE2Q96DL1 559 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 GIMAP5Q96F15 307 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 DGAT2Q96PD7 388 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NANOGQ9H9S0 305 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TPT1P8Q9HAU6 139 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NTMQ9P121 344 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ZNF639Q9UID6 485 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TCFL5Q9UL49 500 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 VPS4AQ9UN37 437 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 AK5Q9Y6K8 562 aa7.6□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TENM4Q6N022 2769 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 C17orf105B2RV13 164 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CLIC1O00299 241 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SOCS6O14544 535 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 GYG2O15488 501 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms