RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 IRF8Q02556 426 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DUSP8Q13202 625 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DOC2AQ14183 400 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.894e-26■■□□□ 12.6
DDX39B-211ENST00000449757 TGFBIQ15582 683 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 KIF18BQ86Y91 864 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GPSM1Q86YR5 675 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 LACC1Q8IV20 430 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 LINC01560Q8TB33 94 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD7Q92527 254 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DIO2Q92813 273 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MBD6Q96DN6 1003 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TRIB1Q96RU8 372 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 EHD1Q9H4M9 534 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 JMJD1CQ15652 2540 aa9.47□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CLCA1A8K7I4 914 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TAPBPO15533 448 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 STK16O75716 305 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TGFB1P01137 390 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CD22P20273 847 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CPA2P48052 419 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF136P52737 540 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ARL4CP56559 192 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DCAF7P61962 342 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MGAT5Q09328 741 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CHIT1Q13231 466 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LAPTM5Q13571 262 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM198Q66K66 360 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 STEAP4Q687X5 459 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CHSY3Q70JA7 882 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PM20D2Q8IYS1 436 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TAGAPQ8N103 731 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SLC15A4Q8N697 577 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 C18orf12Q96KH6 178 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MS4A8Q9BY19 250 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 DERL2Q9GZP9 239 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CNIH4Q9P003 139 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 RNF112Q9ULX5 631 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 MED12LQ86YW9 2145 aa9.46□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 AHRRA9YTQ3 701 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 TP53I11O14683 189 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 PRAMEF4O60810 478 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 EPPINO95925 133 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 INHBBP09529 407 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 FBXO45P0C2W1 286 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC166P0CW27 439 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 EPXP11678 715 aa9.45□□□□□ -0.9
DDX39B-211ENST00000449757 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms