RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 OR1C1Q15619 314 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC1-211ENST00000560983 ZIC1Q15915 447 aa3.5□□□□□ -1.85
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HERC1-211ENST00000560983 RBBP7Q16576 425 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC1-211ENST00000560983 SLC5A12Q1EHB4 618 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC1-211ENST00000560983 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC1-211ENST00000560983 PARP15Q460N3 678 aa3.5□□□□□ -1.85
HERC1-211ENST00000560983 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.5□□□□□ -1.85
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HERC1-211ENST00000560983 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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HERC1-211ENST00000560983 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
HERC1-211ENST00000560983 SLCO2A1Q92959 643 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC1-211ENST00000560983 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HERC1-211ENST00000560983 EID2BQ96D98 161 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC1-211ENST00000560983 TBC1D31Q96DN5 1066 aa3.49□□□□□ -1.85
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