RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.4□□□□□ -1.54
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR4F21O95013 312 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CER1O95813 267 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TDGF1P13385 188 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMD1P17707 334 aa5.39□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL10P22301 178 aa5.39□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARFIP1P53367 373 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STX1BP61266 288 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBPL1P62380 186 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HHEXQ03014 270 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF33BQ06732 778 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHIT1Q13231 466 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNA13Q14344 377 aa5.39□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPS6KA2Q15349 733 aa5.39□□□□□ -1.55
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