RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PP18 115 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 E7EQ34 232 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AGR2O95994 175 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AOC1P19801 751 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PGDP52209 483 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GRIK2Q13002 908 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM215Q68D42 235 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZS52 159 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM69Q86WT6 500 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF480Q8WV37 535 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TADA1Q96BN2 335 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ACADVLP49748 655 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RALGDSQ12967 914 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KANK2Q63ZY3 851 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 THAP11Q96EK4 314 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 P2RY12Q9H244 342 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 REEP4Q9H6H4 257 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ABI3Q9P2A4 366 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RARRES3Q9UL19 164 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KNL1Q8NG31 2342 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0J9YY10 115 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLCO2B1O94956 709 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MATN4O95460 622 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GBAP04062 536 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GABRG2P18507 467 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 UFM1P61960 85 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZXDBP98169 803 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ACY1Q03154 408 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TOMM20Q15388 145 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AAGABQ6PD74 315 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 COX18Q8N8Q8 333 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR10A6Q8NH74 314 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 M0R3G1 203 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 B4GALT2O60909 372 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 COQ9O75208 318 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AQP1P29972 269 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TRPC1P48995 793 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 EPS8Q12929 822 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB134Q4QY38 66 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MTX3Q5HYI7 312 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NRROSQ86YC3 692 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 HPS6Q86YV9 775 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CGREF1Q99674 301 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NTMT1Q9BV86 223 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KRT84Q9NSB2 600 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MUTYHQ9UIF7 546 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PPC4 97 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TSPAN11A1L157 253 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NPPAP01160 153 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DGKQP52824 942 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC14AQ86T13 490 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR7G3Q8NG95 312 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ISL2Q96A47 359 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 BIRC7Q96CA5 298 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 F2RL3Q96RI0 385 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GABRG3Q99928 467 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms