Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17190V9GX38 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17190V9GX38 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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