Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc166S4R181 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms