Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac5Q9Z2V6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac5Q9Z2V6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms