Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Crlf3Q9Z2L7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms