Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd1Q9Z2E2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms