Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Cldn7Q9Z261 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn7Q9Z261 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn7Q9Z261 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn7Q9Z261 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms