Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccne2Q9Z238 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms