Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms