Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shcbp1Q9Z179 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.4 ms