Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stxbp4Q9WV89 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stxbp4Q9WV89 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms