Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapaQ9WV55 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VapaQ9WV55 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms