Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms