Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn8aQ9WTU3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn8aQ9WTU3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms