Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpv2Q9WTR1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms