Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms