Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PplQ9R269 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PplQ9R269 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PplQ9R269 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PplQ9R269 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PplQ9R269 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PplQ9R269 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms