Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcm1Q9R0L6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcm1Q9R0L6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms