Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt71Q9R0H5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt71Q9R0H5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms