Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms