Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsjQ9R014 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms