Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col4a3Q9QZS0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms