Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nphp1Q9QY53 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nphp1Q9QY53 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nphp1Q9QY53 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nphp1Q9QY53 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nphp1Q9QY53 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nphp1Q9QY53 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nphp1Q9QY53 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nphp1Q9QY53 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms