Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx8Q9QXV1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms