Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Limd1Q9QXD8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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Limd1Q9QXD8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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