Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer2Q9QWW1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms