Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pias4Q9JM05 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms