Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms