Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cabp1Q9JLK7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms