Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace2Q9JL18 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms