Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scamp4Q9JKV5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms