Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Habp4Q9JKS5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Habp4Q9JKS5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms