Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
AtrQ9JKK8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AtrQ9JKK8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms