Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gpa33Q9JKA5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms