Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra4Q9JJT2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra4Q9JJT2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms