Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Caln1Q9JJG7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms