Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip1Q9JJ57 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Kcnip1Q9JJ57 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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