Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc6l2Q9JIM3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms